В стенах Спасо‑Преображенского мужского монастыря пребывают почитаемые святыни с частицами мощей:
- святителя Спиридона Тримифунтского — христианского епископа IV века, прославившегося многочисленными чудесами как при жизни, так и после смерти.
Он считается скорым помощником в житейских трудностях: жилищных вопросах, материальных нуждах, сложных жизненных ситуациях.
Спиридон был пастухом, став епископом, продолжал пасти скот и вёл простой образ жизни. Его описывали как гостеприимного и щедрого. Спиридон презирал роскошь и стяжательство. Путешествовал, побывал в Антиохии, участвовал в Сардикийском соборе (343), на котором поддержал святителя Афанасия Великого. Согласно поздним сведениям, Спиридон ездил в Александрию и участвовал в Первом Вселенском соборе.Историки V века Сократ Схоластик и др. и житийные источники говорят о множестве чудес Спиридона, совершённых как при жизни (наказывал воров, скупых и лжецов, помогал бедным, воскресил свою дочь, спас от казни оклеветанного друга, исцелил императора Констанция II, разрушил языческий храм, совершил чудо умножения елея, сослужения ангелов и др.), так и после смерти. В VII веке после арабского нападения на Кипр, мощи Спиридона были перенесены в Константинополь, после 1453 года — на остров Корфу (Керкира). Святителя Спиридона считают покровителем Корфу. Считается, что он спасал остров от турок и пожаров.

- святителя Луки Крымского (1877-1961) — небесного покровителя врачей, целителя душ и телес, к которому обращаются за исцелением и поддержкой в лечении. Выдающийся церковный деятель, исповедник веры, а также знаменитый хирург и учёный, в миру он известен как Валентин Феликсович Войно-Ясенецкий.
Отсидев 11 лет в сталинских лагерях, архиепископ-хирург был награжден медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне», высшей церковной наградой – правом носить на клобуке алмазный крест – и Сталинской премией первой степени по медицине.
В 1946 году, став архиепископом Симферопольским и Крымским и получив эту высокую государственную награду, он из 200 тысяч рублей премии 130 тысяч перечислил в помощь детям, пострадавшим в войну.
В 2000 году канонизирован Русской православной церковью как священноисповедник. Память — 29 мая (11 июня) и 5 (18) марта — день обретения его мощей в 1996 году.
- икона с частицами мощей пензенских святых — Иоанна Оленевского, Иннокентия Пензенского и Иоанна Кочетовского. Это подвижники благочестия, чья жизнь была неразрывно связана с нашей землёй, ныне предстоят у Престола Божия и молятся за свой народ, подавая благодатную помощь всем, кто с верой обращается к ним.
Иван Калинин родился 5 (17) августа 1862 года в селе Оленевка Пензенского уезда. Вёл строгую жизнь: спал мало, занимался ремёслами (вязание, сапожное дело), чтобы зарабатывать на хлеб. В 65 лет (в 1920 году) Пензенским архиепископом Иоанном (Поммером) он был рукоположен в сан диакона. В 1924 году против Иоанна развернули клеветническую кампанию в местной печати – у него отобрали дом, и он жил у родственников или духовных чад.
В последние годы к отцу Иоанну за духовным советом и утешением приходили люди из разных мест. Он стяжал дары прозорливости, исцеления и духовного наставничества. 26 марта 1951 года неизвестные сильно избили старца, а 24 июля (по старому стилю) 1951 года он скончался.
Святитель Иннокентий Пензенский (в миру Иларион Дмитриевич Смирнов) родился 30 мая 1784 года в селе Павлово Богородского уезда Московской губернии. Будучи деятельным противником модного тогда мистицизма, он столкнулся с противодействием. В результате был переведён сначала в Уфу, а затем в Пензу – 2 марта 1819 года в Казанском соборе Санкт-Петербурга хиротонисан во епископа Пензенского и Саратовского. Несмотря на слабое здоровье, он активно занимался архипастырской деятельностью: осматривал церкви, благоустраивал архиерейский дом, присутствовал на экзаменах в духовных учебных заведениях.
Скончался 10 октября 1819 года. Его почитают как небесного покровителя Пензенской земли.
Иоанн Кочетовский (в миру Иван Иванович Поташев) родился 1 января 1839 года в селе Кочетовка Нижнеломовского уезда Пензенской губернии. От одного из монахов лавры Иоанн получил благословение на подвиг юродства — мнимого безумия ради Христа. С 26 лет и до самой смерти он нёс этот тяжёлый путь. Проявлял большое сострадание к обездоленным, имел от Бога дар предвидения. Он часто предупреждал людей о грядущих бедах. Скончался 12 июня 1886 года.
- икона с частицей мощей великомученика и целителя Пантелеимона — небесного врача, к которому издревле прибегают в болезнях и скорбях, прося об исцелении тела и укреплении духа.
Великомученик и целитель Пантелеимон родился в конце III века в Никомидии (Малая Азия). Став христианином, Пантелеимон посвятил жизнь помощи людям: безвозмездно лечил больных, посещал узников в темницах. Он исцелял не только медицинскими средствами, но и призыванием имени Христа.
Императором Максимианом святой был приговорен к усекновению головы. Во время молитвы меч, который воины приготовили для казни, стал мягким, как воск. Воины хотели отказаться от убийства, но Пантелеимон уговорил их исполнить приказ. Когда ему отсекли голову, из раны потекло молоко, а маслина рядом мгновенно покрылась плодами. Брошенное в костёр тело не сгорело и было погребено христианами.
После кончины от мощей святого продолжали совершаться исцеления.
- серебряный крест и ковчежец с мощами. Согласно летописи Керенского Тихвинского женского монастыря, серебряный крест и ковчежец с мощами был подарен сёстрам обители в благодарность за вышитое облачение Иерусалимским Патриархом Мелетием.
После революции святыня была передана на хранение в Пензенский краеведческий музей, где и хранилась до недавнего времени. Сейчас для ковчежца и перламутровых украшений изготовили резной оклад и аналой, а также написали икону с ликами святых, мощи которых находятся внутри.
Посвящены мученикам Иерусалимским: Харалампию, Екатерине, Иулиании, Феодору Тирону, Евстафию, Игнатию Богоносцу, Феодору Стратилату, мученице Варваре, мч. Пантелиимону, мц. Матроны. Поклониться святыне можно в верхнем храме нашей обители.

- икона с мощами свщмч. Иоанна Рижского.
Священномученик Иоанн (Поммер), архиепископ Рижский занимал Пензенскую кафедру в сложнейший период борьбы с обновленческим церковным расколом – с 1918 по 1921 годы. В первые месяцы своего пребывания в Пензе иерарх жил в Спасо-Преображенском монастыре (за городом, в районе современной улицы Индустриальной).
Частица честных мощей святого была передана в Пензенскую епархию в 2006 году, тогда было положено начало широкому почитанию священномученика в Пензе, а в октябре 2015 года митрополит Пензенский и Нижнеломовский Серафим совершил закладку в Пензе первого в мире храма в честь Иоанна Рижского.

- икона с мощами преподобного Феодора Санаксарского, Праведного воина Феодора Ушакова и преподобноисповедника Александра.
Иконостас Спасо-Преображенского мужского монастыря
